2000年，新的KOF大賽召開了。不用說，這背後又有一個天大的陰謀。看多了奇怪的劇情，這一代的就有些淡然無味了。倒是冰雪少女庫娜的出現，讓人眼前一亮，有點驚豔的感覺。故事仍是與NESTS的戰爭，而且看不出已近最終決戰。結局……自然是陰謀家ZERO在一番並不激烈的反抗後被主角們打倒了……KOF2000，是SNK公司的顛峰之作，是難以正確評估的一代。從畫面的精致上來看，無疑是超越了前作。從招式的華麗上來看，也超越了前作。但是卻有許多人對其評價低下，只因無法適應改進的護援模式。這樣一部空前的作品，只怕也是絕後的——它的護援角色竟比戰鬥角色還要多，簡直有主次不分的感覺。而隨時可以呼叫護援的設計，又讓一絲血戰勝滿血成了常事。在這個遊戲中，善用護援成了頭等大事，本身的戰鬥力倒被許多人忽略了，應該說，違背了格鬥遊戲的理念。
通用操作方法：A：輕拳B：輕腿C：重拳D：重腿
前沖：→→後退：←←
小跳躍：向上方短按↖或↑或↗
中跳躍：沖刺中按↖或↑或↗
大跳躍：沖刺中按住↖或↗
防衛並緊急回避-前方：防衛中→+AB同時按（消費能量）
防衛並緊急回避-後方：防衛中←+AB同時按（消費能量）
特殊攻擊：CD同時按
防衛並特殊攻擊：防衛中CD同時按（消費能量）
防衛彈開：給與防衛中的對手一定時間的連續攻擊
投技：前行靠近對方→+C
受身：倒地前按AB同時按
STRIKER系統：BC同時按“可得到同伴的幫助”
反擊模式：ABC同時按，效果：人物閃紅色“可無限制使用超必殺，必殺技可接超必殺(且必殺技威力增強)”
裝甲模式：BCD同時按，效果：人物閃黃色“防衛超必殺不減血、受到攻擊不[太]後退、可移動攻擊”
挑撥對手：START鍵
KOF2000恢複了傳統的緊急回避，取消了閃後進攻。遊戲速度進一步的整體提高。反擊模式和防護模式沒有太大的變化。防護模式的時間增長了，反擊模式和防護模式的輕擊造成的硬直相當于以前重擊造成的硬直。模式發動時會轟飛靠近的對手。而KOF2000最大的特點是STRIKER MATCH系統的增強。攻擊中通常技或必殺技、通常投、解拆投技、倒地前都可以呼叫援助。也使得連續技的華麗程度成爲KOF系列之最。
二零零零年——就像N.E.S.T.S組織預料的一樣，全球的恐怖事件正一輪接一輪的展開著。與此同時哈迪蘭上校（Heidern）與他的部下覺得事情與K'，Maxima他們兩人有關，並策劃去調查他們。正當哈迪蘭上校准備跟蹤K'與Maxima時卻得知令一場格鬥比賽即將開幕，《格鬥之王2000》爭霸賽。世界各地的格鬥家收到了邀請卡准備全力應戰，但是他們萬萬沒想到的是K'與Maxima也在隊伍中。此外，神秘組織N.E.S.T.S所發出的邀請卡意味著第二階段的計劃已經開始了。神秘組織N.E.S.T.S的行動是個巧合？又或者是……？只有時間才能證明這一切。就像暴風雨之前的平靜，混亂即將開始！拳皇大賽又開幕了.就在大賽快要結束的時候，ZERO殺死了巴西傭兵指揮官淩先生，放置了克隆人在海頓身邊，最後用等離子大炮想叛變N.E.S.T.S......
