《拳皇97風雲再起加強第二版》此版本是在“拳皇97”原版的基礎上改編而來，其中解鎖了幾名超級角色，包括八神、草雉京、大蛇、BOSS等等，同時加入了幾個隱藏必殺，喜歡的玩家千萬別錯過。
《拳皇97》是“大蛇篇”三部曲中的最後一章，講述了各路決鬥家組成隊伍參加拳皇大賽，卷入八傑集複活大蛇的陰謀，並最終爲這場因緣之戰畫上休止符。
大蛇處加上問號可以隨機選人，過關可以再選
鎖定遊戲八級難度，特效改成綠光
更換選人背景、勝利後回複全血量
麻宮雅典娜必殺時幻城了夏季泳裝
頭像替換爲拳皇98的人物頭像
增加了閃光特效、普通爲藍色閃光、超必殺爲紅色閃光
全人物的出招形態有所改變
